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亞(ya) 氨基二乙酸-瓊脂糖
1 、產(chan) 品介紹
IDA NUPharose HP 是含亞(ya) 氨基二乙酸(iminodiacetic acid,IDA)基團的金屬螯合填料,適用於(yu) 大部分帶組-氨酸標簽(His-tag)蛋白的親(qin) 和層析。,HP為(wei) High Performance的縮寫(xie) ,意為(wei) 高分辨,微球的平均粒徑為(wei) ~35μm。IDANUPharose HP未螯合金屬離子,用戶可螯合Ni2+、Co2+、Cu2+、Zn2+ 等金屬離子後使用。
通過獨-特的配基修飾工藝,這款產(chan) 品做到了親(qin) 和力和特異性的平衡:對大部分帶組-氨酸標簽蛋白的結合量大於(yu) 50 mg/mL的同時,一步純化後樣品純度可達90%以上。
2 、產(chan) 品特點與(yu) 技術指標
產(chan) 品名稱 | 亞(ya) 氨基二乙酸-瓊脂糖 |
基質 | 6%高度交聯瓊脂糖 |
配基 | 亞(ya) 氨基二乙酸,可螯合~18 μmol Ni2+/mL,配基密度和螯合金屬離子的種類 可定製 |
粒徑範圍 a | 20~50 μm |
平均粒徑 | ~35 μm |
動態結合載量 b | ≥50 mg/mL 帶組-氨酸標簽蛋白 |
推薦工作流速 | 60~150 cm/h |
最大流速與(yu) 壓力 c | 300 cm/h,≥0.5 MPa |
pH 穩定性 d | 4~8.5(推薦的工作 pH),3~12(長期穩定);2~14(短期穩定) |
化學穩定性 | 在以下溶液中穩定:常用的水相緩衝(chong) 液、1 mol/L 氫氧化鈉、8 mol/L 尿素、 6 mol/L 鹽酸胍、70%乙醇等。 |
儲(chu) 存與(yu) 運輸 | 20%乙醇,2~30 ℃ |
注:a90%體(ti) 積以上的微球在此粒徑範圍;bDBC10%測試條件為(wei) :10%流穿,大腸杆菌表達帶組-氨酸標簽的重組金黃色-葡萄球菌蛋白A,6 min 停留時間;c 10 cm 柱高下的最大測試流速;d 未螯合金屬離子狀態下的pH 穩定性。
3 、金屬螯合親(qin) 和層析——IDA
金屬螯合親(qin) 和層析是基於(yu) 蛋白質分子表麵的組氨-酸的咪唑基、半胱-氨酸的巰基和色-氨酸吲哚基能與(yu) Cu2+、Ni2+、Zn2+、Co2+等金屬離子形成穩定的配位結合而進行生物大分子分離純化的過程。其中,以Ni2+為(wei) 螯合離子來純化6個(ge) 或更多組-氨酸組成的Hig-tag標簽蛋白最為(wei) 常見,本說明書(shu) 也以該體(ti) 係為(wei) 例簡要闡述IDA NUPharose HP的親(qin) 和原理(圖 1)。
NUPharose基球修飾上IDA配基後,該配體(ti) 擁有三個(ge) 配位基團,其中一個(ge) 氮原子和兩(liang) 個(ge) 氧原子可以與(yu) Ni2+形成牢固的螯合物。Ni2+可形成6配位數的八麵體(ti) 結構,剩餘(yu) 的三個(ge) 自由配位點可以與(yu) 溶劑分子或蛋白質分子結合。Ni2+與(yu) 組-氨酸標簽蛋白的組-氨酸殘基的咪唑基團配位結合的過程即為(wei) 金屬螯合填料與(yu) 目標蛋白的特異性結合過程。提高緩衝(chong) 液中咪唑的濃度可以將目標蛋白洗脫,洗脫過程中咪唑和目標蛋白競爭(zheng) 與(yu) Ni2+的結合。降低pH會(hui) 影響金屬離子與(yu) 配體(ti) 的結合,因此改變pH也是金屬螯合層析洗脫過程的方式之一,但pH不宜低於(yu) 4,pH過低會(hui) 將剝離金屬離子。通常也用pH4的醋酸鈉緩衝(chong) 液清洗螯合Ni2+後的填料,以除去未穩定螯合的Ni2+。
金屬離子親(qin) 和層析過程的非特異性吸附可能來自離子相互作用、金屬離子與(yu) 含組-氨酸、半胱-氨酸、色-氨酸的雜蛋白之間的相互作用。前者通過提高緩衝(chong) 液的離子強度得到抑製,通常添加500mM的NaCl;後者可在上樣緩衝(chong) 液中添加少量的咪唑(例如~5mM)或者在衝(chong) 洗過程中添加咪唑而除去。經過優(you) 化,可以得到樣品純度和收率均較高的結果。Ni-IDA NUPharose HP填料在使用過程中Ni2+脫落量少,可連續使用多次。當填料性能明顯下降後可以用EDTA將原金屬離子剝離,重新螯合鎳後再生使用。不同金屬離子對目標蛋白的親(qin) 和力與(yu) 特異性不同,Cu2+、Ni2+、Zn2+、Co2+的親(qin) 和力依次降低(影響產(chan) 率),特異性依次升高(影響純度),可根據分離需求選定合適的金屬離子。對於(yu) 大多帶Hig-tag標簽的重組蛋白,Ni2+通常是首先考慮的金屬離子,建議使用螯合Ni2+的Ni-IDANUPharose HP。對於(yu) 含組-氨酸、半胱-氨酸或色-氨酸的非標簽蛋白,Cu2+的高親(qin) 和力有利於(yu) 結合目標蛋白。對於(yu) 磷蛋白,可考慮使用四價(jia) 或者三價(jia) 離子。值得注意的是,上述規律不總是成立,需根據目標蛋白篩選合適的金屬離子。
4 、使用方法參考
4.1 色譜柱裝填
以下闡述與(yu) 層析係統連接時,填料的色譜柱裝填方法。
(1)所有需要用到的材料的溫度要與(yu) 色譜操作的溫度一樣,液體(ti) 最好做脫氣處理。
(2)填料用量計算:通過沉降定量填料體(ti) 積,需要的沉降填料體(ti) 積=柱體(ti) 積×壓縮比(也稱壓縮因子)。沉降體(ti) 積是指填料在20%乙醇保存液中自然沉降完-全讀取的穩定體(ti) 積。IDANUPharose HP 的壓縮比為(wei) ~1.20。為(wei) 使達到裝柱比,可通過柱頭下壓的方法,也可以通過高流速壓柱。
(3)填料清洗:將填料懸液充分搖勻後量取相應體(ti) 積,抽濾除去液體(ti) ,並用約3倍填料體(ti) 積的純化水洗滌,重複3次,以除去保存液。
(4)裝柱填料懸液準備:將填料轉移到適當的容器中,加入適量的裝柱液,製成50~75 v%的裝柱填料懸液,使用前攪勻。
(5)裝填前準備:在清洗幹淨的層析柱下端加入裝柱液,以除去下墊片及層析柱下 端的空氣,在柱內(nei) 保留少量的蒸餾水,擰緊下堵頭,調整柱子使其垂直於(yu) 地麵。
(6)裝填:將攪勻後的填料懸液一次性緩慢倒入層析柱內(nei) (必要時使用裝柱器), 為(wei) 避免引入氣泡,應使之沿層析柱內(nei) 壁自然流下。將所有填料加入後, 用裝柱液將裝柱 器加滿,擰緊裝柱器上蓋,將柱子與(yu) 層析係統連接。
(7)壓柱:使柱內(nei) 填料自然沉降(或50~150 cm/h的低流速下沉降),待填料沉降完-全後(填料與(yu) 液體(ti) 的界麵清晰),去除裝柱器,裝上上柱頭,並將柱頭下降至界麵處;通過高流速(推薦流速見下表,注意柱壓不超過0.3MPa),繼續壓柱至界麵清晰穩定,標記界麵穩定時的柱高。停泵,打開柱頭上的閥門/堵頭,關(guan) 閉柱底的閥門/堵頭,下壓柱頭至標記位置下方與(yu) 壓縮比對應的位置,旋緊柱頭,裝柱完成。裝柱完成後,需用高流速平衡柱內(nei) 的填料。
4.2 柱效測定和評價(jia)
完成裝柱後、使用前可通過柱效測定和評價(jia) 可以確認層析柱裝填質量。柱效通常用理論塔板高度(HETP)和非對稱因子(As)來評價(jia) 。
4.3 螯合金屬離子
IDA NUPharose HP 以未螯合金屬離子的形式出售,用戶可以在裝柱完成後再層析柱中螯合金屬離子,螯合過程參照以下步驟。
(1)配製50~200 mM的金屬離子溶液,例如螯合Ni2+通常用NiSO4。螯合Ni2+、 Cu2+、Co2+、Zn2+等不同離子的過程基本相同,需注意控製不同pH條件下不同金屬離子的溶解性,pH過高可導致沉澱。螯合Zn2+時,需控製pH=5.5或者更低;螯合Fe3+時,需控製pH=3.0左右。
(2)用純水清洗色譜柱,純水用量 3~5 CV(柱體(ti) 積),流速100~200cm/h。
(3)用0.2~0.8 CV 的金屬離子溶液通過色譜柱,流速50~100 cm/h金屬離子過量50%時足夠螯合完-全。例如 IDANUPharose HP可螯合18 μmol Ni2+/mL,用0.6 CV的50mM NiSO4溶液螯合時,Ni2+過量67%。螯合完-全後色譜柱底部的顏色從(cong) 白色變為(wei) 螯合特定金屬離子的顏色。
(4)用純水清洗色譜柱除去過量的金屬離子,純水用量至少5CV,流速100~200cm/h。
(5)用20mM醋酸鈉+0.5M NaCl(pH=4.0)緩衝(chong) 液將螯合不穩定的金屬離子除去,緩衝(chong) 液用量至少5 CV,流速100~200 cm/h。
(6)可直接用結合緩衝(chong) 液平衡色譜柱。
在裝柱前螯合金屬離子的過程與(yu) 上述在色譜柱中螯合一致,可在旋勻儀(yi) 、反應瓶(釜)中螯合金屬離子,利用過濾器清洗螯合前後的填料。
4.4 平衡與(yu) 上樣(Equilibration & Loading)
金屬螯合填料與(yu) 磷酸鹽、Tris-HCl等緩衝(chong) 體(ti) 係兼容,其中“20mM PB+500mM NaCl(pH=7.4)"的緩衝(chong) 體(ti) 係最為(wei) 常用。初始的緩衝(chong) 液稱為(wei) 平衡緩衝(chong) 液,記為(wei) 緩衝(chong) 液A。緩衝(chong) 液A的特點為(wei) 不含或者含少量咪唑,pH在7~8之間居多,呈弱堿性。實際使用過程中,如果上樣料液的體(ti) 積特別大,從(cong) 降低成本的角度考慮,可不往料液中添加咪唑和NaCl來抑製非特異性吸附,而是在上樣後進行衝(chong) 洗來去除雜質。
在上樣前,需用緩衝(chong) 液A在操作流速下平衡層析柱,該過程通常需要5~10個(ge) 柱體(ti) 積的緩衝(chong) 液A,以電導、pH等檢測信號參數不變且與(yu) 緩衝(chong) 液A對應為(wei) 準。
上樣量可按“mg目標蛋白/mL 填料"來設定,通常為(wei) DBC10%的50~80%,例如Ni-IDANUPharose HP產(chan) 品對重組金黃色-葡萄球菌蛋白A(r-SPA,NRPA04)的DBC10%為(wei) ~50mg/mL,純化 r-SPA 時的上樣量可為(wei) 25~4mg/mL。除了DBC10%,也可以測試上樣流穿液中的目標蛋白確定上樣量。上樣前需要對樣品進行離心(10000g 以 上)或/和過濾(0.22或0.45μm)等澄清處理,以免堵塞色譜柱。樣品的pH和鹽濃度可用緩衝(chong) 液A或濃度更高的母液調節。
上樣後需要3~10個(ge) 柱體(ti) 積的緩衝(chong) 液A再平衡層析柱
4.5 洗雜(Wash)
在緩衝(chong) 液A中添加5~40mM的咪唑衝(chong) 洗層析柱,可以將非特異性結合的雜蛋白除去。咪唑濃度越高,雜蛋白被除去得越徹-底,但會(hui) 降低目標蛋白的收率。洗雜過程咪唑的濃度與(yu) 不同蛋白的特性相關(guan) ,可通過階躍洗雜過程(例如5mM、10mM、20 mM……)快速優(you) 化洗雜條件。洗雜的體(ti) 積通常為(wei) 3~10個(ge) 柱體(ti) 積。
4.6 洗脫(Elution)
最-常用的洗脫方式為(wei) 提高洗脫液中咪唑的濃度(在緩衝(chong) 液A中加入咪唑),推薦在0~500mM範圍內(nei) 進行階躍洗脫或者線性梯度洗脫。對於(yu) 大多數帶組-氨酸標簽的蛋白,200mM的咪唑濃度可以將目標蛋白洗脫完-全。對於(yu) 一些場合,也可以改變pH,結合較弱的蛋白可在pH6時可洗脫,結合較強的蛋白可在pH6~4時洗脫,需注意pH不能低於(yu) 4。
4.7 再生(Regeneration)
在多次使用後,需要對填料進行再生。可以選擇0.5~1柱體(ti) 積200mM EDTA+500 mM NaCl(pH=7)的緩衝(chong) 液將金屬離子剝離。再用50~200mM的金屬鹽溶液與(yu) IDA配基螯合,用純水將過量的金屬離子除去,用20 mM醋酸鈉+0.5 M NaCl(pH=4.0)緩衝(chong) 液將螯合不穩定的金屬離子除去。金屬離子的重新螯合參照4.3小節。
4.8 在位清洗(CIP)
通常上述的再生過程可將填料徹-底清洗。若發生柱壓升高,或為(wei) 了避免交叉汙染,將金屬離子剝離後可進行在位清洗過程。可采用以下溶劑進行在位清洗:2mol/L NaCl ,1mol/L NaOH、70%乙醇或 30%異丙醇等。在位清洗可有效去除介質上的雜質,反向效果更佳。清洗後需用3~5 柱體(ti) 積的純水除去上述溶劑。
4.9 填料保存
填料的初始保存液為(wei) 20%乙醇,使用過後可繼續用20%乙醇保存。保存溫度在2~30 ℃為(wei) 宜,不可凍存。