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更新時間:2017-04-12
瀏覽次數:1445信帆生物帶你全麵了解DNA拓撲異構酶I
DNA拓撲異構酶為(wei) 催化DNA拓撲學異構體(ti) 相互轉變的酶之總稱。催化DNA鏈斷開和結合的偶聯反應,為(wei) 了分析體(ti) 外反應機製,用環狀DNA為(wei) 底物。
在閉環狀雙鏈DNA的拓撲學轉變中,要暫時的將DNA的一個(ge) 鏈或兩(liang) 個(ge) 鏈切斷,根據異構體(ti) 化的方式而分為(wei) 二個(ge) 型。
切斷一個(ge) 鏈而改變拓撲結構的稱為(wei) Ⅰ型拓撲異構酶(top- oisomeraseⅠ),通過切斷二個(ge) 鏈來進行的稱為(wei) Ⅱ型拓撲異構酶(topoisomeraseⅡ)。
屬於(yu) Ⅰ型的拓撲異構酶,有大腸杆菌的ω蛋白(ω-protein,由分子量11萬(wan) 的單個(ge) 多肽鏈所成)及各種真核細胞中存在的切斷-結合酶(nicking-closing enzyme,分子量約6萬(wan) 5千—7萬(wan) 的及分子量約10萬(wan) 的)。
Ⅱ型拓撲異構酶,有存在於(yu) 細菌中的DNA促旋酶、噬菌體(ti) T4的拓撲異構酶Ⅱ以及真核細胞中依賴ATP的拓撲異構酶Ⅱ等。
另外,噬菌體(ti) λ的irt基因產(chan) 物和噬菌體(ti) φX174的基因A的產(chan) 物等也具有切斷—結合酶的活性,可認為(wei) 是拓撲異構酶之一種。
Ⅰ型拓撲異構酶不需要ATP的能量而催化異構體(ti) 化,作為(wei) 反應的中間產(chan) 物,在原核生物來說是遊離型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端與(yu) 酶形成共價(jia) 鍵,而真核生物是3′-OH末端5′-磷酸末端與(yu) 酶形成共價(jia) 鍵。
此酯鍵中所貯存的能量,可能在切斷端的再結合上起著作用。Ⅰ型拓撲異構化酶催化的反應有下列各種:使超螺旋DNA在每一切斷—結合反應中,使L數(參見DNA拓撲學異構體(ti) )發生一種變化,即鬆弛(relaxation)。
將互補的單鏈環狀DNA轉變成具有螺旋結構的雙鏈環狀DNA,使單鏈DNA打結(topological knot)或解結。
另外在二個(ge) 環狀雙鏈DNA一個(ge) 分子的一個(ge) 鏈切斷時,形成鏈環狀二聚體(ti) 的分子(ca-tenane)。
信帆生物帶你全麵了解DNA拓撲異構酶I
在Ⅱ型拓撲異構酶中,DNA促旋酶可單獨催化閉環狀DNA產(chan) 生超螺旋,這是*的。其它二個(ge) 型的酶,除可使超螺旋鬆弛也需要ATP的能量外,還可催化促旋酶的催化反應。
真核細胞的拓撲異構酶Ⅰ,參與(yu) 核小體(ti) 的形成,細菌的ω蛋白參與(yu) 轉錄和某種轉位子的插入。促旋酶和T4拓撲異構酶Ⅱ參與(yu) DNA的複製和轉錄過程。
DNA拓撲異構酶在DNA解鏈時在將要打結或已打結處作切口。下遊的DNA穿越切口並作一定程度的旋轉,把結打開或解鬆,然後旋轉複位連結。
這樣解鏈就不因打結的阻絆而繼續下去。即使出現打結現象,雙鏈的局部打開,也會(hui) 導致DNA超螺旋的其他部分過度擰轉,形成正超螺旋。
拓撲酶通過切斷、旋轉和再連接的作用,實現DNA超螺旋的轉型,即把正超螺旋變成負超螺旋。
I (DNA Topoisomerase I)催化4種反應:
1)催化負超螺旋DNA的鬆弛。
2) 在單鏈環狀DNA分子內(nei) 形成繩結(Knot t ing) 和解開繩結(Unknotting)。
3)催化具有互補堿基序列的環狀單鏈DNA形成雙鏈閉環狀DNA分子。
4)2個(ge) 環狀雙鏈DNA分子之中的一個(ge) 存在DNA鏈的切口時,發生兩(liang) 個(ge) 分子的連結反應(Catenation)或者逆反應(Decatenation)。
完整的DNA 拓撲異構酶I(E. coli)全酶是一分子量97 kDa的蛋白。本DNA 拓撲異構酶I是把topA基因(E. coli)在大腸杆菌中進行表達後,經多次純化分離而得到的。
質量保證
本DNA 拓撲異構酶I 經多次柱純化,SDS-PAGE膠檢測僅(jin) 可見清晰單一的目的條帶;PCR方法檢測無大腸杆菌DNA殘留,無核酸內(nei) 、外切酶汙染。
使用建議
DNA的結構轉換和解析。
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