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《自然》雜誌:蛋白結構分析的新裏程碑

更新時間:2013-12-04      瀏覽次數:1702

利用X射線晶體(ti) 學技術研究蛋白質結構,需要用許多已知數據,來填補數據的缺口。而現在,科學家們(men) 應用X射線新技術,從(cong) 頭解析了蛋白質的準確結構,構建了該蛋白的完整3D模型,這是蛋白結構分析的一個(ge) 重要裏程碑。

溶菌酶(lysozyme)是一種已經被廣泛研究的蛋白。日前,美國能源部(DOE)SLAC國家加速器實驗室的研究人員,使用直線加速器相幹光源LCLS(Linac Coherent Light Source)和複雜的計算機分析工具,從(cong) 頭生成了溶菌酶的準確模型。這項研究於(yu) 十一月二十四日發表在Nature雜誌上。

一直以來,由於(yu) 許多重要蛋白的結晶體(ti) 太小,傳(chuan) 統的X射線技術難以對其進行分析。而LCLS的特殊性質能夠幫助人們(men) 解析更小的結晶體(ti) ,揭示更多重要的蛋白質結構。

在用X射線技術確定蛋白結構時,需要綜合海量數據以獲得足夠準確的信號,對於(yu) 缺乏參考數據的蛋白來說,並不那麽(me) 實用。“現在我們(men) 的實驗顯示,新X射線技術可以從(cong) 頭展現未知生物結構的確切信息。”馬普醫學研究所的科學家Thomas Barends說。

蛋白的結構直接決(jue) 定著它們(men) 的功能(例如,蛋白與(yu) 其它分子的結合/相互作用),蛋白結構分析能夠為(wei) 人們(men) 提供重要信息,幫助人們(men) 開發高度靶向性的治療藥物。迄今為(wei) 止,人們(men) 所了解的蛋白結構,大多離不開X射線晶體(ti) 學技術。一個(ge) 世紀以來,許多諾貝爾獎成果都得益於(yu) 這一技術。

早在數十年前,人們(men) 就解析了溶菌酶的結構。現在研究人員利用這一蛋白,來考量新X射線技術的準確性。他們(men) 將溶菌酶晶體(ti) 浸泡在含有釓的溶液中,這種金屬與(yu) 溶菌酶結合,能夠在X射線的照射下產(chan) 生強信號。研究者們(men) 利用釓原子的這種信號,對溶菌酶分子的結構進行了準確的重建。

研究團隊準備進一步調整和改善這一技術,將其應用於(yu) 更多更複雜的蛋白質,如膜蛋白。膜蛋白承擔了大量的重要細胞功能,是新藥研發中的重要靶標,然而人們(men) 目前隻知道少數膜蛋白的結構。

“這項研究是一個(ge) 重要的裏程碑,”曼徹斯特大學的化學教授John R. Helliwell說。“X射線技術迎來了新的機遇,可以解析更小樣本的3D結構,這一點令人鼓舞。”

LCLS在短短幾年的應用中,就獲得了如此成就,Barend相信“X射線檢測設備、相關(guan) 軟件、以及結晶技術的進一步發展,定會(hui) 在不久的將來催生更多的新成果”。

蛋白的結構直接決(jue) 定著它們(men) 的功能,蛋白結構分析能夠為(wei) 人們(men) 提供重要信息,幫助人們(men) 開發高度靶向性的治療藥物。迄今為(wei) 止,人們(men) 所了解的蛋白結構,大多離不開 X射線晶體(ti) 學技術。一個(ge) 世紀以來,許多諾貝爾獎成果都得益於(yu) 這一技術。然而,倘若科學家利用 X 射線晶體(ti) 學技術研究蛋白質結構,需要用許多已知數據,來填補數據的缺口。

現在,來自馬克斯普朗克醫學研究所的科學家與(yu) 美國SLAC國家加速器實驗室合作,開發出了一種 X 射線新技術,從(cong) 頭解析了蛋白質的準確結構,構建了該蛋白的完整 3D模型,這是蛋白結構分析的一個(ge) 重要裏程碑。

溶菌酶(lysozyme)是一種已經被廣泛研究的蛋白。研究人員使用直線加速器相幹光源 LCLS (Linac Coherent Light Source)和複雜的計算機分析工具,從(cong) 頭生成了溶菌酶的準確模型。

一直以來,由於(yu) 許多重要蛋白的結晶體(ti) 太小,傳(chuan) 統的 X 射線技術難以對其進行分析。而 LCLS 的特殊性質能夠幫助人們(men) 解析更小的結晶體(ti) ,揭示更多重要的蛋白質結構。

在用X 射線技術確定蛋白結構時,需要綜合海量數據以獲得足夠準確的信號,對於(yu) 缺乏參考數據的蛋白來說,並不那麽(me) 實用。而這項實驗顯示,新 X射線技術可以從(cong) 頭展現未知生物結構的確切信息。

早在數十年前,人們(men) 就解析了溶菌酶的結構。現在,研究人員利用這一蛋白,來考量新X射線技術的準確性。他們(men) 將溶菌酶晶體(ti) 浸泡在含有釓的溶液中,這種金屬與(yu) 溶菌酶結合,能夠在X射線的照射下產(chan) 生強信號。研究者們(men) 利用釓原子的這種信號,對溶菌酶分子的結構進行了準確的重建。

研究人員計劃進一步調整和改善這一技術,將其應用於(yu) 更多更複雜的蛋白質,如膜蛋白。膜蛋白承擔了大量的重要細胞功能,是新藥研發中的重要靶標,然而人們(men) 目前隻知道少數膜蛋白的結構。

令科學家愛備受鼓舞的是,由於(yu) 這項裏程碑意義(yi) 的研究,X 射線技術將迎來新的機遇,可以解析更小樣本的3D結構。

LCLS 在短短幾年的應用中就獲得了如此成就,這讓研究人員相信 X 射線檢測設備、相關(guan) 軟件、以及結晶技術的進一步發展,會(hui) 在不久的將來催生更多的新成果。

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