分析病毒

分析病毒

艾默裏大學生物學副教授Katia Koelle說，SARS-CoV-2病毒變種的出現在對抗CO-VID-19的鬥爭(zheng) 中增加了曲折，表明需要對該病毒進行更好的基因組監測。

Koelle說：“改進的跨州SARS-CoV-2基因組監測確實將幫助我們(men) 更好地了解引起大流行的病毒在美國的發展和傳(chuan) 播。”“需要更多的聯邦資金，以及用於(yu) 樣本收集和基因測序的集中標準。研究人員需要訪問此類元數據，以便更好地跟蹤病毒在地理上的傳(chuan) 播方式，並確定可能難以控製的任何新變種，以便衛生官員可以更快，更有效地做出反應。”

Koelle研究了病毒進化與(yu) 病毒傳(chuan) 染病流行病學傳(chuan) 播之間的相互作用。她是《觀點》文章的高級作者，該文章剛剛發表在《科學》雜誌上，有關(guan) SARS-CoV-2測序對控製CO-VID-19大流行的重要性。

邁克爾·馬丁(Michael Martin)是埃默裏(Emory)的人口，生物學和生態計劃的博士研究生，也是科勒(Koelle)實驗室的成員，是《科學》雜誌的第-一作者。大衛·範因斯伯格(David VanInsberghe)是科勒實驗室的博士後研究員，是該書(shu) 的合著者。

馬丁說：“對SARS-CoV-2的研究一直以迅雷不及掩耳的速度進行。”“這種加速為(wei) 我們(men) 提供了迄今為(wei) 止-快的針對疾病的大數據集之一。到目前為(wei) 止，我們(men) 已經學到了很多關(guan) 於(yu) 這種病毒如何傳(chuan) 播和適應的知識，但是我們(men) 仍然有很多盲點需要解決(jue) 。”

基因組是生物體(ti) 的遺傳(chuan) 物質。人類基因組由雙鏈DNA組成，以四個(ge) 不同的核苷酸堿基字母編碼。一個(ge) 人類基因組由超過30億(yi) 個(ge) 堿基對組成。相反，包括SARS-CoV-2在內(nei) 的冠狀病毒的基因組是由RNA組成的，RNA的結構比DNA更簡單。例如，SARS-CoV-2基因組由一條隻有30,000個(ge) 字母長的RNA鏈組成。排序是一種可以讀取這些字母的技術。

本文總結了有關(guan) SARS-CoV-2的關(guan) 鍵見解，這些見解已通過從(cong) 各個(ge) 患者樣品中對其基因組進行測序而獲得。它還列舉(ju) 了仍然存在的挑戰，包括將元數據收集和整合到遺傳(chuan) 分析中，以及需要開發更有效和可擴展的計算方法以應用於(yu) 成千上萬(wan) 的基因組的需求。